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CIA 섹터 8 오퍼레이터인 '악셀 오프데프로'의 추천으로 카일 워커가 크라이시스로 영입됨.
처음에는 크라이시스의 본대인 중앙전술타격대로 투입될 뻔했지만 스테판 아일랜드(자신의 고향이 각종 재난과 가일란트 코프의 연관성을 이유로)로 투입되길 희망해서 스테이츠 그룹 기동분대로서 스테판 아일랜드에 투입됨. (이때 카일은 자신의 오랜 전우인 체드윅 듀건도 함께 영입할 것을 제안함)
카일은 오래 전 군사학교 동기인 체드윅 듀건(이하 호넷)과 같은 분대원으로서 배치받았으며 군사 및 인성 평가로 카일은 분대장 역할을 맡게 됨.
투입 된 직후부터 이미 한차례 지나간 태풍으로 인해 스테판 아일랜드의 도시들은 이미 쑥대밭이 되어 있었고 연방의 상황이 상황이니만큼(가일란트 실효 지배와 그로 인한 무력해진 연방 정부) 연방 정부에 대한 스테판 아일랜드의 어떠한 지원도 넉넉히 받지 못하고 있는 상황.
카일은 우선 투입되면서 받은 첫 임무인 물자 조달(재난으로 인해 스테판 아일랜드의 크라이시스 대원들에게 원활한 물자 지원이 되지 않았으나 재난이 잠시 멈춘 지금 카일이 속한 N차 투입 대원들과 함께 필요 물품 보급 임무를 맡게 됨) 첫 임무인 보급 임무는 어떠한 문제 없이 원활하게 안전가옥으로 전달하는 데 성공하며 이 안전가옥에서 앞으로 임무 수행을 함께 할 분대원 2~3명을 만남.(이 분대원들은 재난으로 인해 분대장을 포함한 분대원 절반이 손실된 분대였음. 리더로 자리잡을 마땅한 인물도 없었기에 새로운 분대장과 함께 렉싱턴 분대와 합체한 것)
렉싱턴 분대에 합류한 대원들 중 한 여성 대원이 '이 곳에서는 가일란트 코프보다 더 신경쓰고 경계해야할 것이 많다'고 충고함(연방 중심은 물론 각종 치안이 안좋은 지역보다 아예 공권력이 정상적으로 작동하지 않을 정도로 각종 범죄 조직들이 들끓으며 이것에 애를 먹는 것은 스테판 아일랜드에 존재하는 가일란트 코프 또한 마찬가지이다.) 이때 이 여성 대원은 카일에게 생존에 대한 것을 강조함.
스테판 주둔 가일란트 코프의 고위 연구원을 생포하는 임무에서 예고와는 달리 더 빠르게 재난이 찾아왔으며 이번에는 지진과 동반된 태풍이 불기 시작함. 태풍의 주기는 강약 상관 없이 더 빨라졌으며 이로 인해 가일란트 코프, 스테이츠 그룹 양측 모두 외부와 연결이 완전히 끊기게 됨.
(후에 이유를 쓸 것이지만 모종의 이유로 스테판 주둔 가일란트 또한 가일란트 코프 본사로부터 버림받음. 이유는 이미 스테판에서 진행중이던 R&D 연구 자료와 주요 연구원들을 모두 본사로 옮겨놓은 상태인데다가 스테판 주둔 가일란트 사는 본사의 결이랑은 다른 부패한 기업 그 자체였기에 본사에게 이들은 그저 걸림돌일 뿐이였음.)
이 재난이 있고 시간이 흘러(1~2년) 이 곳은 연방 정부로부터 완벽히 격리당하여(연방 정부가 구조 시도 조차 못하고 있던 이유는 가일란트 본사가 스테판 주둔 가일란트 사가 외부로 빠져나올 것을 완벽하게 차단하기 위해 이 곳과 연결된 다리는 모조리 끊어버렸고 모든 연결로를 완벽 차단시켜놨음. 극도 위험 구역으로 구분하면서.) 이 곳에 주둔해있는 섹터 8 요원들, 스테이츠 그룹 대원들, 스테판 주둔 가일란트사, 민간인들과 범죄자들 모두 고립되었음. 공권력은 아예 사라졌고 이제는 생존만이 목적이 된 지역이 되버림. 태풍 또한 가일란트 본사를 돕듯이 주기가 빨라져 자주 찾아왔음.
카일의 분대는 카일과 체드윅, 또다른 분대원 한명만 남았으며(위에 상술된 여성 대원은 아님) 나머지 대원들은 모두 작전 중 사망했음.
로그 대원(변절 대원)들이 속출한다거나 지속적인 본대와의 연결에도 연결이 실패, 물자와 보급품들은 부족해지고 각종 범죄 집단들이 더 심하게 활개치고 있음. 일반적인 폭도부터 시작해 광신도들, 군사 물품을 털어 결성한 무장 세력들, 심지어는 이 곳에 주둔해있던 센트럼 연방군들도 재건과 치안 유지를 목적으로 무력 행사를 하고 있는 변질된 군대, 가일란트 코프까지 그냥 개막장 수준에 들어감.
심지어 가일란트 코퍼레이션 본사에서 스테판 아일랜드 주변 일대에 신호 방해 전파 장치, EMP 재머를 설치하며 그나마 드론을 통해 받던 소량의 물자 지원이나 인력, 심지어 외부와의 교신 자체가 불가능한 상황에 완전히 스테판 아일랜드에 고립되는 최악의 상황에 빠짐.
카일 또한 어느 순간부터 투입될때 부여받은 임무인 가일란트 코프 R&D 자료를 훔치는 것은 희석되고 생존과 이 곳을 복구하는 것을 목표로 잡음.(작중에 나오지 않은 1~2년동안 무고한 민간인들이 학살당하고 범죄자들이 들끓고 파괴되는 도시를 보며 임무보다는 자신의 신념을 따르기로 결정함.)
그렇게 여기저기 안전가옥을 돌아다니며 자신만의 생존을 하는 도중 폭도들로 인해 파괴된 민간인 밀집 구역을 발견하게 됨. 이 곳에서 어린 여자 아이인 세라 알렌을 발견하게 되고 세라를 다음 안전가옥 발견 전까지 동행하기로 결정함.
그렇게 여정 후에 다음 안전가옥에 도착하지만 이들은 더 이상 민간인 수용을 거부하고 있음.(물품 부족으로 인한) 또한 더 이상 스테이츠 그룹 대원들을 불신하고 있는 상태임. 처음엔 로그 대원들을 생각했지만 이 안전가옥에서 나온 이야기는 전혀 딴판이였음.(참고로 이 곳 안전가옥 대장은 스테이츠 그룹 대원 소속으로 카일이 처음 투입됬을 때 만난 안전가옥 오퍼레이터임. 카일과 같은 기동분대원이였다가 민간인 보호를 위해 스스로 안전가옥 오퍼레이터로 전향함.) 바로 이 곳에 있는 섹터 8 요원들이 바로 가일란트 코프와 합세한 것.(가일란트 코프 또한 이 곳에서 생존을 위해 본사의 군대와는 다른 행보를 걷고 있었음. 민간인들을 약탈하고 스테판 질서 확립을 명분으로 본사보다 더 악랄하게 이 곳을 평정하고 있었음. 민간인 학살까지 자행할 정도로.) 심지어 이 곳 섹터 8 요원들은 가일란트와 함께 민간인 학살까지 도왔으며 이들과 함께하면서 바깥 민간인들은 죽어나갈때 가일란트 코프와 함께 꽤나 호화로운 삶을 보내고 있었음.(고립된 스테판에서는 구하기 어려운 음식은 수두룩했고 각종 약탈로 필요치도 않는 자본까지 가지고 있었음.)(심지어 이들의 실체를 아는 스테이츠 그룹 대원들은 극소수였고 대부분 스테이츠 그룹 대원들은 이 고위인사들의 방벽이 되다가 죽는 일이 허다했음. 카일 또한 그러한 임무에 투입되었던 적이 있었고 그렇게 분대원들을 잃었었음.)(스테판 아일랜드의 섹터 8 요원들은 힘만 있으면 모든 걸 할 수있는 이 무법지대에서 자신만의 왕국을 세우려고 함)
세라를 자신이 오래 전 살던 집에 데리고 옴. 그리고 아까 그 안전가옥에서 받아온 생존 물품(식량과 물, 각종 생존 비품, 안전가옥 오퍼레이터가 그냥 돌려보내긴 그랬는지 약간의 생존 비품만 줌.)을 세라에게 건냄.
세라에게 아까 그 오퍼레이터에게 받은 시계(오퍼레이터가 자기는 더는 필요없다며 줌)를 주며 가장 가까운 안전가옥 위치를 찍어주곤 그 곳으로 가라고 함.
이에 제대로 분노한 카일은 이들을 추적하기 시작했고 이들이 가일란트 코프로 전향할 때 각종 로그 분대도 합세한 것을 찾음. 이 중에서는 자신과 함께 투입된 에드가 분대까지 포함되있었으며 이들을 추적. 4명의 CIA 섹터 8 요원중 차례차례로 한 명씩 사냥해나감.
추적 끝에 가일란트에 붙어먹은 마지막 CIA 요원들과 가일란트 코프 지휘관까지 박살냄.(이 과정 중 남아있던 분대원이 죽었으며 체드윅과 단 둘이 살아남음. 체드윅과 카일의 양동 작전으로 카일은 스테판 주둔 가일란트 사의 이사와 지휘관을 죽였으며 체드윅은 마지막 섹터 8 요원을 생포해옴. 물론 얼굴은 이미 체드윅에게 수차례 두드려맞았는지 피떡이 되있었음.)
카일의 행적을 파악하고 있던 섹터 8의 요원은 세라를 들먹이며 카일을 자극함.
-'내가 왜 그 꼬마새끼 이야기를 하는 지 아직도 눈치를 못 챘나?'
사실 그 섹터 8 요원은 에드가를 세라에게 보냈고, 카일은 그걸 눈치채자마자 곧바로 세라에게 향함.
에드가가 세라가 있는 안전가옥을 습격해 모두를 죽임.
카일이 세라가 있는 곳에 도착했을 땐 이미 세라는 죽어있었음. 카일은 오직 응징과 추적을 위해 이런 작은 꼬마 아이를 홀로 두고 간 것을 크게 후회함.(자신의 판단 실수 였다는 것을 뒤늦게 깨닭게 됨.)
에드가 분대는 이미 떠나 없고 카일이 세라를 보고 절망하고 있을 때 에드가 분대가 다시 나타나(렉싱턴 분대 제거를 위해 나타남) 그 자리에서 곧바로 전투가 시작됨.
"렉싱턴! 네가 여기 올 줄 알았지. 어때! 내가 준 선물은!"
에드가 분대와 함께 마지막 CIA 섹터 8 요원도 함께 나타남. 에드가 분대와의 전투 중 카일은 도망가려는 CIA 요원의 다리에 총을 쏘며 도망 못가게 함. 마침내 쓰러진 에드가를 제압한 카일.
" 더 이상 난동을 피우면 맨헌트 프로토콜이 가동될 거다!"라는 에드가의 경고를 무시하고 "이젠 상관 없어."라고 말한 후 기어가던 CIA 섹터 8 요원을 사살하곤 제압되있는 에드가를 향해 총을 쏨.(이 때 권총의 장탄이 모두 떨어졌음에도 계속 방아쇠를 당김. 틱틱 소리를 내며.)
"맨헌트 프로토콜 활성화. 당신은 맨헌트 대원으로서 AIDA 서버의 1순위 수배 대상으로 지정되며 모든 크라이시스 대원들의 추적을 받게 됩니다."
세라의 죽음에 자책하던 카일은 가일란트 코프가 무너져도 이들을 무너트린 자신의 상관들, 즉 CIA와 센트럼 연방 정부가 가일란트 해체 이후 정부의 주도권을 잡게 되어도 지옥은 끊기지 않을 거라고 생각한다. '책임 없는 자에게 권력을 주면 안된다.'라는 신념을 다잡으며 자신과 함께 할 로그 대원을 모으며 끝.
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